2 Profile, eines schnell, eines lahm

Doch, das zu erwähnen habe ich vergessen.

Die Bereinigung durch das Löschen der *.msf kam schon ziemlich zu Beginn.

Gibt es eine Möglichkeit, die Einstellungen aus about:config beider Profile zu vergleichen (wenn das Problem überhaupt da liegt, ist aber anzunehmen, oder?), z.B. die Inhalte aus about:config als TXT zu exportieren?

Ja, könnte man man mit extremem Zeitaufwand, aber ungewissem Ergebnis, weil dieses nichts über den Zustand der prefs.js aussagt, in der diese Einträge sind.
Viel weniger zeitaufwendig wäre es, testweise ein neues Profil einzurichten mit ein zwei Konten und das Verhalten von dort aus zu überprüfen. Läuft es dort OK, migriert man dann mit Hilfe des Add-ons ImportExportTools
die Ordner/Mails. Die Adressbücher exportiert man im alten Profil als *.ldif und importiert sie im neuen.
Das Umschichten von 2 prefs.js wird mit ziemlicher Sicherheit schiefgehen.